Позиции в Яндексе отличаются от указанных в отчете, как это объяснить?

 Яндекс проявил очередную заботу о пользователях, и с 12.12.2012 ввел в работу алгоритм, учитывающий персональные интересы пользователя. Теперь поисковая выдача на каждом ПК будет зависеть от того, что искал человек за этим ПК в течении прошлых двух месяцев (более давние данные не учитываются) и на какие сайты он переходил. Частые переходы на один сайт считаются накруткой и могут приводить к понижению этого сайта в результатах персонального поиска.

Более подробно про персональный поиск можно прочесть на сайте Яндекса, а в дополнение - почитать про персональные ответы Яндекса.

Обращаем внимание, что позиции сайтов наших заказчиков снимаются в Яндексе таким образом, будто бы на ПК, с которого выполняется поиск, ранее никто не работал, это так называемые "чистые результаты поиска", когда Яндексу нечего учитывать для изменения выдачи в плане персональных интересов.

Также Вы можете настроить на своем ПК "чистые результаты поиска", путем выхода из аккаунта Яндекса, удаления всей истории поиска, удаления кук браузера. Более подробно можно прочитать здесь.

В дополнение к написанному выше, с 2016го года, на разных серверах Яндекса данные могут быть не синхронизированы, поэтому даже в приватном режиме позиции сайта могут отличаться в зависимости от города, в котором выполняется поисковый запрос. Это наиболее ярко видно, если воспользоваться различными сервисами по съему позиций, и сравнить их результаты - они будут отличаться на несколько позиций. Такое отличие в позициях связано с особенностями работы серверов Яндекса и не может быть устранено нашими силами.